Ce logo, réalisé dans une typographie sobre, présente deux parties distinctes : le M et le reste, comme si le logo avait été découpé. Cette conception détachée permet de rappeler l'un des sorts les plus emblématiques de la magie et ses spectacles : couper une personne en deux. On y retrouve aussi l'oeil, symbole du regard, de l'attention et de l'analyse, afin de rappeler le côté ludique et informatif du musée et l'attention nécessaire pour observer, analyser, découvrir et apprendre. L'oeil possède également une dimension magique et mystérieuse.